Dehidrasi
Molekul air yang digunakan pada tahapan fiksasi dapat mengganggu tahapan selanjutnya dari proses pembuatan preparat (kecuali metode beku). Tahapan pembuangan air tersebut, disebut dengan tahapan dehidrasi. Untuk kebanyakan jaringan, tahapan dehidrasi diikuti dengan tahapan penjernihan (Clearing) sehingga jaringan menjadi jernih (transparan) sebelum diinfiltrasi.